甘肃省228株临床分离结核分枝杆菌DNA分型初步研究

摘要：

目的 了解目前甘肃结核分枝杆菌流行株的基因型特征,并评价两种基因分型方法的应用价值.方法 收集甘肃省结核分枝杆菌临床分离菌株,分别采用多位点数目可变串联重复序列分析(multiple-locus variable number tandem repeat analysis,MLVA)和间隔区寡核苷酸分型(spacer oligonucleotide typing,Spoligotyping)技术进行基因分型,用BioNumerics软件进行聚类分析后,进行结果综合分析、比对.结果 利用MLVA分型方法,228株结核分枝杆菌被分为4大基因群,7个主要基因型;Spoligotyping可将228株结核分枝杆菌分为4个基因群,8个主要基因型,其中最大的基因型为北京家族基因型.两种方法在基因型分型方面经卡方检验差异无统计学意义(x2=0.06,P＞0.05).结论 两种方法对结核分枝杆菌的分型效果良好,重复性高,操作简便,可试用于大规模分子流行病学调查.北京家族是甘肃最主要的流行基因群.

关键词：结核分枝杆菌、基因分型、多位点串联重复序列分析、间隔区寡核苷酸分型

所属期刊栏目：16

分类号：R378.91+1(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家自然科学基金;甘肃省兰州市重点科研项目

在线出版日期：2015-04-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：161-166