5株口蹄疫病毒VP1和3A基因的序列分析

摘要：

为了解广东地区口蹄疫病毒(FMDV)遗传进化情况,本研究从广东采集5份疑似FMDV感染病料,对样品进行RT-PCR扩增,经克隆测序后,对FMDVs基因序列比对和遗传进化分析.鉴定结果显示,这些病料样品中2份为O型FMDV感染,3份为A型FMDV感染.2个FMDV O型样品中VP1基因的全长均为639 bp,编码213个氨基酸,3A基因的全长均为459 bp,编码153个氨基酸;3个FMDV A型样品中VP1基因的全长均为636bp,编码212个氨基酸.3A基因的全长均为459bp,编码153个氨基酸;与国内外分离的O/A型病毒株VP1基因核苷酸序列相比较发现,2个O型病毒VP1基因与O/BY/CHA/2010株核苷酸序列相似性最高(95.0％),均属于耿马谱系FMDV(属ESA基因型);3个A型病毒VP1基因与A/GDMM/CHA/2013株核苷酸序列相似性最高(99.2％),均属于Asia型FMDV.本研究通过对FMDV遗传进化分析为我国FMDV流行病学的研究提供了基础数据,同时对临床上不同型疫苗的选择提供依据.

关键词：口蹄疫病毒、VP1基因、3A基因、RT-PCR

所属期刊栏目：38

分类号：S852.65(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家生猪产业技术体系CARS-36

在线出版日期：2016-09-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：609-613