马铃薯Y病毒两个黑龙江烟草分离物的 全基因组序列分析
为明确黑龙江烟区马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)分子株系和进化特征,从哈尔滨和牡丹江感病烟草采集到Harbin和MDJ两个样品,通过RT-PCR扩增了其全基因组序列,并进行了一致率、重组、系统发育和选择压力等分析.结果表明,2个分离物(GenBank登录号分别为MH933741和MH933742)基因组全长均为9699核苷酸.Harbin与MDJ和比利时分离物GBVC 26(JQ969039)一致率最高,为98.5％;MDJ与Harbin和GBVC 26一致率最高,为98.5％.Harbin是美国分离物Oz和瑞士分离物N-605的重组体,MDJ是美国分离物CW和N-605的重组体.利用全基因组序列构建的系统进化树显示,PVY分离物分为9个组,Harbin和MDJ均属PVYN-Wi组.PVY的11个基因均处于负选择,其中NIa蛋白基因的选择压力最大.
马铃薯Y病毒、基因组全序列、系统发育分析、重组分析
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黑龙江省烟草公司项目HN201703;山东省烟草公司项目KN238-201602;泰山学者建设工程TS201712023
2019-07-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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