普通烟草热激转录因子家族的全基因组鉴定与分析

摘要：

热激转录因子(heat shock transcription factor,Hsf)家族成员广泛参与植物生长发育和非生物胁迫的调控.本研究应用生物信息学和比较基因组学方法从普通烟草中鉴定了49个Hsf家族成员,发现这些Hsf家族成员均具有较为保守的寡聚化结构域.通过系统进化分析可将烟草和拟南芥的Hsf家族成员划分成3个分支与14个亚家族.共线性分析显示烟草Hsf基因与双子叶植物(拟南芥,番茄和葡萄)Hsf基因组成共线基因对的数量要大于与单子叶植物(水稻和玉米)Hsf基因组成共线基因对的数量.全基因组复制预测共有12个NtHsf基因可组成7条复制基因对.启动子分析发现NtHsf基因启动子区域存在着多个与非生物胁迫相关的顺式作用元件.表达模式分析证实NtHsf家族成员在不同组织的表达具有差异,并且大多数NtHsf家族成员可响应热和干旱胁迫.研究结果可为烟草Hsf转录因子家族成员的功能研究奠定生物信息学基础.

关键词：普通烟草、热激转录因子、共线性、全基因组复制、表达模式

所属期刊栏目：43

分类号：S572.01

资助基金：中国农业科学院科技创新工程;湖南中烟工业有限责任公司科技项目;中央级公益性科研院所基本科研业务费专项

在线出版日期：2022-07-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：47-56