利用GBS技术开发烟草SNP标记及遗传多样性分析

摘要：

研究烟草种质资源的遗传背景,为烟草种质资源的高效利用提供依据.采用GBS(genotyping-by-sequencing)技术,挖掘92份烟草种质资源的SNP位点,并进行遗传多样性和遗传结构分析.结果表明,测序共获得了147.165 Gb数据,平均每个样本1.599 Gb,筛选后共获得93 685个高质量的SNP位点;不同地理来源烟草群体等位基因数(Na)为1.27～1.93,观测杂合度(Ho)变化范围为0.22～0.76,期望杂合度(He)为0.32～0.59,多态性位点数(PLN)范围为15 877～44 249,多态性位点比率(PPL)为26.61％～74.17％,遗传多样性指数(H)为0.19～0.52,遗传距离(GD)为-0.0148～0.3849.基于遗传距离的NJ聚类将材料划分为两个类群;群体遗传结构分析表明,本研究所用材料基于模型可划分为4个亚群.通过GBS技术得到的测序数据量较大且质量较高,群体多态性较高,整体遗传多样性偏低,群体结构划分与种质来源不完全相关.

关键词：烟草、GBS、SNP、遗传多样性、遗传结构

所属期刊栏目：39

分类号：S572.03

在线出版日期：2019-01-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：17-24