10.13496/j.issn.1007-5119.2017.01.003
普通烟草ERF转录因子亚家族成员鉴定及表达模式分析
乙烯结合响应因子(Ethylene-responsive element binding factors,ERF)家族广泛参与植物的生长发育、逆境调节及激素信号应答等过程.利用生物信息方法,鉴定普通烟草基因组ERF转录因子亚家族成员,并对该亚家族成员的染色体定位、理化性质、系统发生、保守结构域、亚细胞定位和组织表达模式进行分析.结果显示,目前在普通烟草中得到121个ERF基因,在烟草24条染色体分布位置具有不均匀性.通过构建进化树,根据拟南芥ERF亚家族的分类方式将烟草ERF亚家族分为6组,同一分组成员的理化性质及保守域呈现高度一致性.亚细胞定位分析结果显示,绝大部分成员定位在细胞核,少数定位在线粒体和叶绿体上.组织表达模式分析结果显示,烟草ERF基因在幼根、成熟根、离体叶和茎中表达量较高,不同分组成员之间表达存在差异.
普通烟草、ERF基因家族、生物信息、表达模式、基因家族
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S572.03
国家自然科学基金项目“拟南芥MUR3基因通过影响木葡聚糖结构参与细胞伸长的分子机制研究”31470291;“拟南芥MYB52转录因子调控果胶质去甲酯化过程的分子机制”31670302;国家科技部支撑计划项目“高生物量能源植物和新型生物质资源培育与综合利用示范”2015BAD15B03
2017-04-18(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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