普通烟草DREB转录因子的序列鉴定与表达分析

摘要：

DREB转录因子含有一个保守的AP2/ERF结构域,在植物抗逆过程中起关键作用.利用生物信息学分析手段,以拟南芥DREB家族成员序列为参照,在普通烟草(Nicotiana tabacum)基因组公共数据库中鉴定出了68个DREB转录因子.对烟草DREB转录因子家族进行了理化性质、系统进化、保守结构域和表达分析.结果表明,普通烟草基因组编码68个DREB转录因子家族成员,氨基酸数目差异较大;系统发育分析表明,拟南芥和烟草的DREB转录因子共125个成员形成6个进化分支,其中烟草比拟南芥缺少A6分支;结构域分析表明,同一分支内的DREB转录因子的保守结构域以及motif具有高度的一致性;组织表达分析表明,大多数DREB家族基因在烟草中表达量较低,在衰老、干旱和病害胁迫下基因表达量较多.此研究将为烟草DREB转录因子的深入分析奠定了生物信息学基础.

关键词：DREB转录因子、普通烟草、生物信息学、表达分析

所属期刊栏目：38

分类号：S572.03

资助基金：国家烟草专卖局烟草基因组计划重大专项“烟草高香气、抗青枯病、抗TMV突变体鉴定及中烟100、翠碧一号品种定向改良”110201301005JY-05

在线出版日期：2017-04-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

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