四川凉山地区烟草黑胫病菌的ITS序列分析

摘要：

本研究利用真菌核糖体基因转录间隔区（ITS）通用引物，PCR 扩增四川省凉山州不同地区的20株烟草黑胫病菌的ITS序列，并对PCR产物进行了克隆测序。结果表明，20个供试菌株的ITS1-5.8S-ITS2总长均为803 bp；各菌株之间的ITS序列同源性达到99.3%以上；与GenBank报道的寄生疫霉台湾烟草分离株Phytophthora parasitica（GU111675.1）的同源性在99.6%~100%之间；但各菌株ITS序列的个别位点存在突变，这些突变主要集中在ITS2区上，其中第468处的突变具有一定地域性，主要为德昌和西昌的菌株。利用MEGA6软件对20个供试菌株及GenBank中登陆的15个疫霉属菌株序列进行聚类分析，供试菌株与 GenBank 上登录的 GU111675.1、KF010303.1、AJ854295.1、KC768775.1、L41383聚在同一聚类组上，均为Phytophthora parasitica（或Phytophthora nicotianae），其它疫霉种聚在不同的聚类组上，遗传关系较远，这表明来自四川凉山不同地区的20株烟草黑胫病分离菌株均为寄生疫霉（Phytophthora parasitica）。

关键词：烟草黑胫病、ITS、寄生疫霉、烟草

分类号：S572.09

资助基金：四川省烟草公司凉山州公司科技项目“凉山州烟草黑胫病发生规律及防治研究”201203002

在线出版日期：2015-04-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：96-101