10.11665/j.issn.1000-5048.20160105
基于药效团模型及虚拟筛选方法发现 EphB4全新抑制剂
采用计算机模拟手段,通过建立3D-QSAR 模型、虚拟筛选及分子对接方法发现恶性肿瘤治疗靶标 EphB4潜在的抑制剂。首先,通过 Catalyst/HypoGen 算法建立药效团模型。其中最好的模型 Hypo1具有最高的科雷尔值(Correl 值):0.96,最低的 RMS 值:0.89,与固定消耗值(fixed cost):89.20,最接近的总消耗值(total cost):101.26,和最高的Δ消耗值(Δcost 值):89.14。随后,Hypo1经过测试集验证及 Fischer 随机验证,并用于筛选化合物数据库。然后利用类药性筛选及分子对接手段进一步减少分子数量。最终,根据预测活性分析、对接得分值及结合模式分析,得到23个具有全新骨架的化合物作为 EphB4的潜在抑制剂可用于后续研究。
EphB4、3D-QSAR 模型、虚拟筛选、分子对接、Catalyst/HypoGen 算法、肿瘤靶标
R914.2(药物基础科学)
四川省科技支撑计划资助项目No.2011SZ0116This study was supported by the Science and Technology Pillar Program of Sichuan Province 2011SZ0116
2016-04-05(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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