广州地区婴幼儿感染Noro病毒基因型的初步研究

摘要：

目的 探讨广州地区婴幼儿腹泻中感染Noro病毒的基因型.方法 用Clustal W比对GⅡ组Noro病毒后,设计处于ORF 1与ORF 2连接点两旁两对简并引物,进行巢式RT-PCR扩增出目标片段,克隆于T载体上,测定序列,对ORF1与ORF 2连接点两旁序列和衣壳蛋白N/S区用Clustal W进行同源性分析,用phylip 3.65软件、邻接法构建进化树.结果 标本NVgz100、NVgz10成功扩增出ORF 1与ORF 2连接点两旁1 208 bp片段(相对于Hawaii virus,U07611位置为4476-5683),包含ORF 1的3′端RdRp的大部分基因和ORF 2基因的5′端的S区.对标本NVgz100、NVgz10与另一实验NVgz01(DQ369797)的1 208 bp进行同源性分析发现,3份标本与G Ⅰ组同源性为58%～61%,与GⅡ组同源性为74%～92%;将这3份标本与G Ⅰ、GⅡ组构建进化树,可发现NVgz100、NVgz10和NVgz01与GⅡ组Bristol等病毒密切相关,将NVgz100、NVgz10和NVgz01的衣壳蛋白N/S区与GⅡ组各基因型进行同源性比较,发现3份标本与GⅡ-4基因型Camberwell、Bristoh Grimsby同源性较高(92%～96%),与其他基因型同源性为70%～73%,以N/S区构建进化树可发现3份标本与Camberwell、Bristol、Grimsby、Lordsdale处于同一簇中.结论 本实验结果表明Noro病毒株以GⅡ组为主,病毒流行的基因型为与Camberwell、Bristol、Grimsby和Lordsdale等密切相关的GⅡ-4基因型.F

关键词：Noro病毒、GⅡ-4基因型、同源性比较、进化树分析

所属期刊栏目：1

分类号：R1(预防医学、卫生学)

在线出版日期：2006-12-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：273-278