三氯叔丁醇影响缩宫素在溶液中分布行为的分子模拟
目的:利用分子动力学(molecular dynamic,MD)模拟方法研究三氯叔丁醇对缩宫素在水溶液中分布行为的影响.方法:以Schrsdinger软件构建不同数量缩宫素和三氯叔丁醇与7 500个水分子的5个体系,以AMBERTOOL12设置体系力场参数,以Gromacs软件采用AMBER03力场进行10 ns的NVT模拟,记录模拟轨迹,计算均方位移(MSD)、扩散系数、氢键、相互作用残基等参数.结果:缩宫素在水中是一种逐步聚集的动态过程,500个三氯叔丁醇对10个缩宫素分散良好,增加三氯叔丁醇到1 000个分子可以导致缩宫素在三氯叔丁醇相中聚集.水中缩宫素参与聚集的氨基酸随机性较大,在三氯叔丁醇相中的聚集为首尾相互作用.三氯叔丁醇的加入可以降低缩宫素与水氢键相互作用.结论:缩宫素在水中有自聚的倾向,在适当浓度下三氯叔丁醇具有明显的分散作用.
缩宫素、三氯叔丁醇、分子动力学模拟、分散作用
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R943.42;R979.1(药剂学)
国家“重大新药创制”科技重大专项资助项目2015ZX09303001;国家自然科学基金面上资助项目81673026;天津市科委应用基础与前沿计划重点资助项目16JCZDJC34800
2018-12-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共8页
2564-2571
