基于TCGA数据库分析代谢限速酶相关基因对胃癌患者预后的影响及生存模型预测

摘要：

目的 采用生物信息学方法,构建胃癌(Gastric Cancer,GC)患者代谢限速酶表达的预后评估模型,并判断对GC患者预后情况.方法 从肿瘤基因组图谱(the cancer genome atlas program,TCGA)数据库中下载375例GC和32例正常组织标本的RNA测序数据,使用R语言筛选得到差异表达的代谢限速酶.采用Lasso回归模型分析并构建差异代谢限速酶预后模型并对该预后模型的有效性进行验证.此外,使用单因素和多因素COX分析评估临床特征、风险评分是否可以作为GC预后的独立风险因素.结果 筛选得到5个差异表达的代谢限速酶(DCK、GAD1、UCK2、GNE和SOAT1),并建立GC代谢限速酶相关的预后模型,该模型的ROC曲线下面积为0.777,证实该模型具有较好的预后预测价值.多因素COX回归分析表明构建的风险评分是影响GC患者总体生存时间的独立因素(HR=8.889,P＜0.001).结论 采用TCGA数据库成功构建了GC代谢限速酶相关基因的预后模型,并为判断GC患者的生存预后情况提供帮助.

关键词：代谢限速酶;胃癌;预后;生物信息学

所属期刊栏目：35

分类号：R446;R735.2(诊断学)

在线出版日期：2022-03-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：914-919