云南省临沧市小管福寿螺COⅠ基因多态性分析

摘要：

目的 通过对云南省临沧市小管福寿螺(Pomacea canaliculata)COⅠ基因的遗传标记分析,了解当地小管福寿螺基因多态性,为云南省后续开展广州管圆线虫病监测提供科学依据.方法 对采自云南省临沧市孟定镇38份小管福寿螺样本进行COⅠ基因扩增,并将PCR产物测序.运用MEGA 6.06软件Kimura-2参数模型,对来自于GenBank的福寿螺单倍型与本研究获得单倍型一起进行系统进化树构建和个体间遗传距离计算,分析其遗传多样性.结果 共获得31条序列,分属3种单倍型(Haplotype1~Haplotype3),其中Haplotype1的频率较高,占整个样本的83.9%(26/31).3种单倍型与小管福寿螺的遗传距离最小,为0~0.052;而与Pila conica的遗传距离最大,为0.021~0.239.进一步进化分析表明,3种单倍型均为小管福寿螺,与来自日本熊本(GenBank登录号:AB 433769)、中国香港(GenBank登录号:KT 313034)和美国夏威夷(GenBank登录号:EU 523129)的小管福寿螺序列聚成一大支,具有较近的亲缘关系;而与P.insularum (GenBank登录号:EF 514942)、P.camena(GenBank登录号:EF 515059)等序列的亲缘关系较远.结论 云南省临沧市存在小管福寿螺,本研究获得的3种单倍型之间存在较大的遗传分化.

关键词：小管福寿螺、COⅠ基因、序列分析、遗传多样性、临沧市

所属期刊栏目：30

分类号：R383.19(医学寄生虫学)

资助基金：国家重点研发计划2016YFC1200500

在线出版日期：2018-06-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：179-183