日本血吸虫侵袭前后的湖北钉螺转录组研究ⅠRNA-Seq数据的de novo拼接
目的 利用基于RNA-seq的二代测序技术分析日本血吸虫侵袭前后的湖北钉螺转录组的表达,为进一步完善湖北钉螺基因结构信息及挖掘血吸虫感染钉螺相关分子标记提供实验数据.方法 分别提取日本血吸虫毛蚴感染后第7天、第30天湖北钉螺组织和正常钉螺组织的总RNA,经RNA质量检测合格后建立eDNA文库,利用Illumina Next-Seq500测序仪进行测序得到原始序列数据;测序数据经过滤和de novo拼接后,进一步开展转录本注释和聚类分析.结果 共得到63686条广泛通用的基因数据(Unique gene,Unigene),基因功能注释及功能群组聚类分析结果显示,一般性功能蛋白质编码Unigene占比最多(15.36%),其次是信号转导(11.75%)、转录后修饰(8.89%)等,此外还有较高比例的未知功能蛋白质编码Unigene(12.20%).结论 日本血吸虫侵袭后的湖北钉螺转录组表达信息显示有数个基因呈显著性上调或下调表达,本研究为从分子水平研究湖北钉螺与血吸虫感染相互作用奠定了基础.
日本血吸虫、湖北钉螺、RNA测序、denovo拼接、转录组
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R383.24(医学寄生虫学)
国家自然科学基金81101280;国家传染病重大专项2012ZX10004220、2012ZX10004-201;中英全球卫生项目202708
2017-07-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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