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10.19556/j.0258-7033.20221124-04

山羊TSPAN6基因克隆及序列分析

引用
TSPAN6是四跨膜蛋白超家族成员之一,与病毒毒力、致病性及肿瘤发生相关.本研究旨在克隆山羊TSPAN6基因序列并进行生物信息学分析.以简州大耳羊为实验对象,无菌采集其肝脏,Trizol 法提取组织总RNA,并反转录为 cDNA,RT-PCR 技术克隆山羊TSPAN6基因序列,利用在线软件进行生物信息学分析.结果显示,成功克隆得到 TSPAN6基因,共 1400 bp(GenBank 登录号:ON337134),包括 5'UTR 149 bp,CDS 区长 738 bp,3'UTR 23 bp,编码 245 个氨基酸残基.山羊TSPAN6基因序列与绵羊、牛、猪、斑马、海豹和狐狸的相似性分别达到 99.32%、98.24%、93.63%、93.90%、92.41%和 92.68%.TSPAN6 蛋白分子式为 C1259H1952N310O346S18,分子质量为 27544.30 Da,是1种偏碱性、稳定的疏水性蛋白.TSPAN6 蛋白无信号肽,存在 4 个跨膜结构域,二级结构显示以 α螺旋为主,无β折叠结构,含有1个N糖基化位点与41个磷酸化位点.亚细胞定位预测 TSPAN6 蛋白主要定位于细胞膜,可能与 MAVS、ZFHX4、SEZ6L2 等 10 个蛋白存在相互作用.本实验成功克隆了山羊 TSPAN6基因,为后续山羊TSPAN6基因功能的研究提供了参考依据.

山羊、TSPAN6基因、基因克隆、生物信息学分析

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S827.2(家畜)

四川省自然科学基金;四川省重点研发项目;四川省畜禽育种攻关项目;浙江省科技计划项目

2023-10-24(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

共7页

133-139

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中国畜牧杂志

0258-7033

11-2083/S

59

2023,59(10)

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