10.19556/j.0258-7033.20230424-06
ssc-miR-152生物信息学及对未成熟猪睾丸支持细胞功能的分析
为研究ssc-miR-152 生物信息学特征及对未成熟猪睾丸支持细胞功能的影响,本研究通过NCBI数据库确定ssc-miR-152 在猪基因组中的位置,通过MethPrimer和EMBOSS在线软件分析ssc-miR-152 上游序列CpG岛,使用Netural Network Promoter Predictio和Promoter-2.0 预测其启动子区域,结合AliBaba 2.1 和AnimalTFDB 3.0 软件预测其转录因子结合位点;Clustal W软件分析ssc-miR-152 在物种间的保守性,采用CCK-8、流式细胞术和实时荧光定量PCR技术检测细胞增殖、周期及凋亡情况,运用miRanda、EIMMO、TargetScan和PITA在线软件预测ssc-miR-152 的靶基因并取交集,并对预测的靶基因进行GO功能及KEGG通路分析,最后利用Cytoscape构建TF-miRNA-mRNA互作网络.结果表明:ssc-miR-152 位于猪 12 号染色体反义链的 24 292 249～24 292 328 位置,其转录起始位点在上游序列 200 bp处,启动子范围为 393～4 619,并在该范围内存在 1 个CpG岛,且有RELA、SP1、SRF、IRF1 和EGR1 等多个转录因子调控ssc-miR-152的表达.同时发现ssc-miR-152 具有高度保守性,在未成熟猪睾丸支持细胞中过表达ssc-miR-152 后增强细胞增殖活性、加快细胞的周期进程、抑制细胞凋亡率.互作网络显示ssc-miR-152 可调控下游NOG、S1PR1和FBN1等多个基因,参与TGF-β、PI3K/AKT和FoxO等信号通路.本研究说明,ssc-miR-152 对未成熟猪睾丸支持细胞生长发育有重要作用,本研究为后续进一步探索未成熟猪睾丸支持细胞机理并对雄性精子发生机理提供理论科学依据.
ssc-miR-152、未成熟猪睾丸支持细胞、生物信息学、功能分析
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S828.2(家畜)
湖南省自然科学基金面上项目2023JJ60247
2023-09-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共10页
240-249
