高通量测序技术分析青海藏羊初乳和常乳微生物多样性

摘要：

为探究藏羊初乳和常乳的微生物组成及多样性,本试验选取体况良好、2～3 胎次的藏羊 6 头,采集初乳(C)和常乳(OM).基于高通量测序技术对 2 组乳样的 16S rDNA的V4 区进行分析,选用PICRUSt进行功能预测.结果显示:97％的一致性共得到 3 413 个OTUs,微生物Alpha多样性指数在藏羊常乳中高于藏羊初乳(P＜0.05).变形菌门(Proteobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes)是 2 组乳样中丰度最高的 2 种菌门,藏羊初乳中 2 种菌门丰富度分别为 77.61％和 11.66％,常乳中为 71.65％和 17.43％.在属水平上,2 组乳样的优势菌属均为假单胞菌属(Pseudomonas)、丛毛单胞菌属(Comamonas),且藏羊初乳中假单胞菌属和乳杆菌属(Lactobacillus)丰度高于常乳.16S rDNA基因KEGG水平功能预测,结果发现常乳在遗传信息处理、复制修复和翻译功能上得到显著富集,初乳在氨基酸代谢功能上得到显著富集.表明藏羊初乳和常乳微生物多样性存在显著差异,并发现常乳在遗传信息处理、复制修复和翻译功能上得到显著富集,初乳在氨基酸代谢功能上得到显著富集.

关键词：藏羊、初乳、常乳、微生物多样性、功能预测

所属期刊栏目：59

分类号：S826.2(家畜)

在线出版日期：2023-05-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：129-135