10.19556/j.0258-7033.20220518-08
碱地黑牛FADS1基因克隆测序及表达分析
实验旨在研究碱地黑牛脂肪酸脱氢酶 1 基因(FADS1)CDS区序列和表达情况,并探讨FADS1基因理化性质及表达规律.本研究通过克隆测序构建FADS1的系统进化树并进行生物信息学分析,用免疫组化技术对FADS1 蛋白进行定位分析,免疫印迹检测FADS1 蛋白在实验组织的表达情况.生物信息学结果显示碱地黑牛FADS1 CDS区长 1 083 bp,编码 360 个氨基酸.FADS1不存在信号肽.FADS1进化树显示碱地黑牛FADS1与牛的遗传距离较近(99.9％),与鸡的遗传距离较远(80.0％).结构预测表明FADS1中α螺旋占 48.61％,β折叠占 3.61％,延长链占 13.06％,无规则卷曲占 34.72％,4 个α螺旋构成四螺旋束并在螺旋肽段之间形成一个疏水性的空腔,整体呈中空的桶状.互作网络解析显示:FADS1与ACSL1、ACSL3、ELOVL2、ELOVL5、PTPLA、PTPLB、ACOX1、ACOX2、ACADM、FASN、TECR等蛋白互作,参与FADS1-ELOVL5-HSD17B12-ACADM-ACOX1、FADS1-FASN-ACADVL-ACOX2等脂肪酸合成、代谢、脂滴生成相关过程的调控网络.亚细胞定位预测表明:FADS1在内质网、线粒体及分泌系统小泡中表达.免疫组化显示FADS1于胞内细胞器表达明显,局限性的分布在胞膜一侧.荧光定量及免疫印迹显示肝中丰度最高(P＜0.01),心脏次之,脂肪最低.综上推测,FADS1基因参与促进碱地黑牛肝脏脂肪酸合成过程,对调控脂质代谢、沉积发挥着重要作用.
FADS1基因、生物信息学、碱地黑牛、免疫组化、免疫印迹
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S823.2(家畜)
种业创新基金6602422011
2023-05-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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