10.19556/j.0258-7033.20220418-04
通过比较转录组分析鉴定山麻鸭开产调控基因
蛋鸭开产与卵巢发育有紧密联系,本实验旨在探索山麻鸭开产前后卵巢形态变化及基因表达的差异,鉴别参与启动开产的关键基因,为后期蛋鸭开产相关的分子遗传机制研究奠定基础.在山麻鸭开产前后的S1期(81日龄)和S2期(137日龄)分别选取3个个体的卵巢基质进行转录组测序,对转录组数据开展差异表达分析、功能富集分析及关键基因筛选,同时对关键基因进行荧光定量PCR(qRT-PCR)验证.在差异倍数log2转换的绝对值(|log2(FoldChange)|)大于1.5、矫正P值<0.05的筛选条件下鉴别出382个差异表达基因.基于382个差异表达基因的GO功能注释发现与卵泡生长和卵巢功能调节相关的通路:细胞外基质的组织、细胞外基质结构成分和含有胶原蛋白的细胞外基质相关途径;KEGG富集分析发现上述基因显著富集于ECM受体相互作用和PI3K-Akt信号通路.在涉及上述重要富集通路的基因中有9个基因交集:CD44、COL1A1、COL6A1、CREB3L1、ITGB2、THBS2、VWF、VEGFC、WNT5B,通过qRT-PCR验证了这9个基因在转录组数据差异表达方面的可靠性.在这9个基因中,COL1A1、COL6A1、ITGB2和VWF已在之前研究中报道与卵泡发育有关,而CD44、CREB3L1、THBS2、VEGFC、WNT5B基因为本研究新发现.本研究为后期山麻鸭开产相关性状的分子遗传机制研究及分子标记辅助选择奠定基础.
山麻鸭、开产、差异表达基因、功能富集
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S834.2(家禽)
国家自然科学基金;广东省现代农业水禽产业技术体系创新团队;国家重点研发计划
2023-04-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共8页
83-89,95
