10.19556/j.0258-7033.20211230-03
芦花鸡HDAC9基因CDS区克隆、生物信息学分析及组织表达分析
为探索组蛋白去乙酰化酶9(Histone Deacetylase 9,HDAC9)基因的功能,明确其在芦花鸡不同组织中的表达差异,实验采集芦花鸡各组织,克隆获得HDAC9基因完整CDS区,进行生物信息学分析及组织表达分析.结果显示,芦花鸡HDAC9基因CDS区长度为3210 bp,编码1069个氨基酸;芦花鸡HDAC9基因氨基酸序列与號鹦鹉、绿头鸭及雉鸡位于一个分支,同源性较高,亲缘关系较近.HDAC9蛋白分子质量约为118.0 ku,分子式为C5145H8261N1499O1613S33,理论等电点为6.33,半衰期为30 h,HDAC9蛋白为水溶性蛋白;HDAC9蛋白存在信号肽,为分泌蛋白;共存在67个潜在的磷酸化位点;存在3个N-糖基化潜在位点.HDAC9蛋白二级结构由α-螺旋、β-折叠、β-转角和无规则卷曲组成,三级结构预测结果与其一致.实时荧光定量PCR结果显示,HDAC9基因在芦花鸡不同组织中表达水平存在显著差异,其中在胸肌中表达量最高,其次为睾丸.本实验结果为进一步探索HDAC9基因生物学功能奠定基础.
芦花鸡、HDAC9、克隆、表达差异、生物信息学
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S831.2(家禽)
吉林省农业科学院基本科研经费项目;吉林省科技厅重点研发项目
2023-02-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共6页
158-163
