10.19556/j.0258-7033.20211128-04
华西牛胴体性状GWAS分析
胴体性状是肉牛生产实践中最重要的经济性状之一.本研究以840头华西牛成年公牛为研究对象,屠宰后分别测量胴体重(CW)、胴体长(CL)、胴体胸深(CD)3个性状的表型值,基于Illumina BovineHD芯片基因分型结果,利用单变量混合线性模型(LMM)和多变量混合线性模型(mvLMM)2种方法进行全基因组关联分析(GWAS),采取Bonferroni方法确定显著性阈值,挖掘影响华西牛胴体性状的显著位点和重要候选基因.结果显示,单性状GWAS分析中仅在CD性状中检测到6个SNPs位点达到染色体显著水平(P<1.65×10-6),注释到5个基因(PDE1C、PPARGC1B、MTX3、RCAN2、DOK6),而在CW与CL 2个性状中没有检测到显著的SNPs位点;多性状GWAS分析结果显示,在CW-CL、CW-CD、CL-CD、CW-CL-CD 4个组合中分别检测到1、5、2、3个显著关联的SNPs位点,共注释到了4个基因(STXBP5L、PDE1C、PPARGC1B、RCAN2).通过对华西牛胴体性状进行GWAS分析,综合利用LMM和mvLMM 2种分析方法以提高位点检测效力和准确性,最终共找到9个显著关联的SNPs位点及STXBP5L、PDE1C、PPARGC1B、MTX3、RCAN2、DOK6 6个基因,其中PPARGC1B、RCAN2 2个基因被不同方法检测到的多个SNPs位点同时注释到,参与体重调节、脂肪细胞增殖和分化等生物过程,以上结果为华西牛胴体性状的改良提供了有效的分子标记.
华西牛、胴体性状、单性状GWAS、多性状GWAS
58
S823.2(家畜)
中国农业科学院科技创新工程重大科研任务;国家肉牛牦牛产业技术体系项目;内蒙古自治区科技计划
2022-11-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共8页
92-99
