猪EEPD1基因变异筛选鉴定及其对猪肌内脂肪含量性状的影响

摘要：

随着社会经济发展与人民生活水平的不断提升,猪肉品质越来越受消费者重视.肌内脂肪(IMF)含量性状是影响猪肉品质的一个关键性指标.本研究发现猪EEPD1基因在肌内脂肪高低组硒都黑猪个体背最长肌组织中差异表达,并进一步利用混合DNA样本池PCR测序法在硒都黑猪群体中筛选鉴定出猪EEPD1基因g.123857 C>G、g.123907 A>G、g.124024 A>G、g.124050 G>A、g.124222 A>G等5个SNP变异位点.经关联分析后发现这5个SNP位点均显著影响IMF性状.其中g.123907 A>G、g.124024 A>G和g.124050 G>A 3个位点紧密连锁,所组成的单倍型也与IMF性状显著相关.生物信息学分析还发现,这5个SNP位点虽然不显著影响EEPD1蛋白结构,但是会导致其mRNA二级结构及稳定性发生变化,推测它们主要通过影响EEPD1蛋白翻译效率进而影响IMF性状.综上,本研究新发现了5个猪肉质性状的分子育种标记,为实现猪肉质性状的快速改良充实基础.

关键词：猪、肌内脂肪含量、EEPD1基因、突变、关联分析

所属期刊栏目：58

分类号：S828.2(家畜)

资助基金：湖北洪山实验室重大项目;湖北省科技重大专项项目;国家生猪产业技术体系项目;湖北省自然科学基金;湖北省重点研发项目;湖北省农业科技创新中心创新团队项目

在线出版日期：2022-08-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：147-152