大白猪繁殖性状全基因组关联分析

摘要：

本研究利用全基因组关联分析(GWAS)挖掘与大白猪总产仔数(TNB)、产活仔数(NBA)和健仔数(NHP)相关的候选基因.选择1100头大白猪为实验材料,通过提取耳尾组织样DNA并利用"中芯一号"芯片进行基因型分型,采用PLINK v1.9对获得的基因型数据进行质控后用于GWAS研究.rMVP软件对每个SNP与性状做关联分析,确定出显著位点.结果表明:对于TNB性状共有3个SNPs呈基因组水平或染色体水平显著;NBA性状共有4个SNPs呈基因组水平或染色体水平显著;NHP分析得到18个SNPs呈基因组水平或染色体水平显著.在上述显著SNPs附近共有23个候选基因,根据基因功能注释推测ESR1、ZP3、YWHAG、HSPB1、MDH2、PCCB是能够影响繁殖性状的重要候选基因.

关键词：猪、总产仔数、产活仔数、健仔数、全基因组关联分析

所属期刊栏目：58

分类号：S828.2(家畜)

资助基金：湖北省科技重大专项项目;湖北洪山实验室重大项目;国家生猪产业技术体系项目;湖北省自然科学基金;湖北省农业科技创新中心创新团队项目;湖北省重点研发计划项目

在线出版日期：2022-08-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：94-99