部分河南地方猪与藏猪选择信号分析

摘要：

本实验旨在对部分河南地方猪和藏猪筛选全基因组选择信号,研究它们之间的遗传分化情况和基因交流情况.实验基于淮南猪、南阳黑猪、确山黑猪、河南野猪、藏猪以及中国野猪6个猪品种共计66个个体的全基因组重测序数据,通过多种软件对重测序数据进行群体结构分析和选择信号分析,同时利用TreeMix软件对河南地方猪与藏猪进行基因流分析.结果显示:河南地方猪、藏猪与野猪的遗传关系比较远,而河南地方猪和藏猪之间的遗传关系较近.通过群体分化指数(Fixation indices,Fst)方法进行选择信号分析,并对分析结果进行基因功能注释和富集分析,共找到369个基因,GO和KEGG富集分析显示,这些基因主要富集于RNA聚合酶II对转录的负调控通路、神经营养因子信号通路等通路,通过查阅文献得到47个与重要性状相关的候选基因.基因流分析显示藏猪与确山黑猪有基因交流情况.

关键词：河南地方猪、藏猪、选择信号、基因流

所属期刊栏目：58

分类号：S828.2(家畜)

资助基金：西藏自治区重大科技专项;国家自然科学基金;河南省科技攻关项目;河南省科技攻关项目;十四五国家重点研发

在线出版日期：2022-08-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：73-78