10.19556/j.0258-7033.20210428-10
乳中不同体细胞数的新疆褐牛STAT5B基因表达及生物信息学分析
新疆褐牛是我国育成的首个乳肉兼用牛品种,具有抗逆性强、体细胞数低、耐粗饲的优点,拥有西北第一牛的美称.前人研究发现,STAT5B基因与新疆褐牛的泌乳性状有关,为了进一步探索STAT5B基因对新疆褐牛泌乳性状的影响,通过采用实时荧光定量PCR技术(RT-qPCR)对STAT5B基因在不同乳房健康程度的新疆褐牛血液中的相对表达量进行分析;同时使用NCBI Blast、ProtParam、ProtScale、SOPMA、SWISS-MODE、MEGA、TMHMM Server v.2.0、SignalP-5.0 Server、WoLF PSORT等生物信息学分析软件对STAT5B基因编码的蛋白进行结构分析与功能预测.RT-qPCR结果表明:STAT5B基因对奶牛乳房炎影响不显著,但STAT5B基因在健康新疆褐牛血液中的表达量高于患乳房炎的新疆褐牛.生物信息学分析结果表明:STAT5B基因编码蛋白的分子式为C4006H6263N1111O1197S25,共编码787个氨基酸;进化树分析结果表明牛STAT5B基因与水牛的亲缘关系较为接近;经预测STAT5B基因编码的蛋白质是一种亲水性蛋白,主要由亮氨酸组成;该蛋白中α-螺旋高达50.95％,β-折叠的含量最少.该分析及预测结果主要为探索新疆褐牛STAT5B基因的功能奠定基础,为阐明其对新疆褐牛泌乳性状的影响提供了理论依据.
新疆褐牛;STAT5B;RT-qPCR;生物信息学分析;体细胞数
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S823.2(家畜)
国家自然科学基金;新疆维吾尔自治区自然科学基金;自治区科技援疆计划项目;国家级大学生创新创业训练计划项目
2022-02-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共7页
106-112
