10.19556/j.0258-7033.20200828-06
利用基因芯片开展广西麻鸡2个群体亲缘关系的遗传分析
本实验旨在揭示广西麻鸡2个群体里当鸡(MA)和灵山香鸡(MB)之间的遗传距离和亲缘关系,为培育市场需求的优质麻鸡配套系提供参考和帮助.实验从MA和MB群体中分别随机抽取25只鸡(公鸡13只,母鸡12只)的血样,利用"京芯一号"鸡55K芯片技术对2个群体的亲缘关系进行遗传分析.通过主成分分析(Principal Component Analysis,PCA),2个群体的个体随机聚在一起,没有出现明显分别聚类的现象.基于状态同源(Idengtical By State,IBS)和G矩阵(二维树状数组)表明2个群体大多数个体间亲缘关系较远.使用邻接法(Neighbor-Joining,NJ),基于IBS遗传距离分析结果对2个群体样本进行聚类,结果表明MA和MB分别聚为一大类,说明2个群体遗传距离较远,群体间亲缘关系相对较远.2个群体基于长纯合片段(Runs of Homozygosity,ROH)的平均近交系数为0.0225,MA和MB群体近交系数分别为0.0189和0.0262,近交系数较低.
鸡;亲缘关系;基因芯片;遗传距离;聚类分析
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S831.2(家禽)
现代农业产业技术体系建设专项资金;江苏省重大品种创制项目;江苏省农业三新工程项目;国家自然科学基金
2021-08-23(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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