RPL35A基因在不同月龄寒泊羊肌肉组织中的表达及其生物信息学分析

摘要：

本实验旨在探究核糖体蛋白基因(RPL35A)在不同月龄寒泊羊肌肉组织中的mRNA表达及其生物学功能.选取1月龄、7月龄和13月龄寒泊公羊各3只,采集背最长肌,利用转录组测序(RNA-seq)与荧光定量PCR (qRT-PCR)技术相结合,分析比较RPL35A基因的表达丰度.应用生物信息学方法分析RPL35A基因的核苷酸和氨基酸序列的分子结构特征、蛋白质特性及网络互作.结果 表明:1月龄寒泊羊背最长肌RPL35A基因mRNA高于7月龄,后者低于13月龄,RNA-seq与qRT-PCR结果趋势一致.绵羊RPL35A基因核苷酸及氨基酸序列与山羊、牛、家马和猪的相似性较高;RPL35A编码蛋白为碱性蛋白(PI=11.07)、亲水蛋白(亲水值为-0.579),稳定性较好,属于非跨膜蛋白,在线粒体(69.6％)、细胞核(17.4％)、细胞质(8.7％)、过氧化物酶体(4.3％)内发挥作用.蛋白互作网络分析表明RPL35A蛋白在核糖体合成过程中发挥着重要作用.综上,RPL35A基因可能参与寒泊羊肌肉生长发育过程.

关键词：RPL35A基因、寒泊羊、生物信息学、mRNA、qRT-PCR

所属期刊栏目：57

分类号：S826.2(家畜)

资助基金：农业农村部政府采购服务项目;河北农业大学人才引进项目

在线出版日期：2021-06-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：85-90