PPP3CA基因多态性与江口萝卜猪肉质性能关联性分析

摘要：

钙调磷酸酶(CaN)是调节肌纤维转化的重要信号分子,PPP3CA基因编码CaN催化亚基,对畜禽肉质性能有重要影响.本实验以江口萝卜猪为研究对象,测定了112头江口萝卜猪11项主要肉质性状指标,提取背最长肌中基因组DNA,扩增了PPP3CA基因全部外显子和启动子序列并测序.结果显示:发现3个SNPs位点,分别为A-918C、G154767A和G316451A.启动子上的A-918C位点等位基因分布较均匀,生物信息学分析发现A-918C位点位于一个高评分核心启动子区附近,还会导致2个转录因子结合位点的消失和2个转录因子结合位点的产生,可能会对PPP3CA基因的表达产生影响.与肉质的关联性分析发现,A-918C位点AA和AC型个体肉色明显高于CC型个体,而剪切力反之.双倍型分析发现,H6H7(CC-GG-GA)和H7H7(CC-GG-GG)肉色显著低于其余双倍型,剪切力明显高于其余双倍型,也说明A-918C位点AA和AC型猪肉质优于CC型猪,说明了A-918C位点对肉质性能有明显影响.G154767A和G316451A位点等位基因频率差异大,等位基因分布不均匀,表明群体内变异程度较低.G154767A位点会使mRNA二级结构最小自由能降低,稳定性降低,极显著偏离Hardy-Weinberg平衡.与肉质的关联性分析发现,G316451A位点GG型和GA型大理石纹评分显著高于AA型.本研究结果表明,PPP3CA基因对江口萝卜猪肉质存在明显影响,A-918C和G316451A位点可能是影响江口萝卜猪肉质的重要功能SNPs位点.

关键词：江口萝卜猪、PPPCA、SNPs、肉质性能、关联性分析

所属期刊栏目：57

分类号：S828.2(家畜)

资助基金：贵州省科技支撑计划项目黔科合[2017]2590号

在线出版日期：2021-01-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：63-71