草原红牛FABP7基因克隆、生物信息学及组织表达差异分析

摘要：

本研究旨在克隆草原红牛脂肪酸结合蛋白7基因(FABP7)的CDS区序列并对其进行生物信息学分析,同时检测其在牛各个组织中的mRNA表达水平.利用RT-PCR技术克隆草原红牛FABP7基因CDS区序列,并使用多种生物软件和在线工具进行生物信息学分析,通过qPCR技术检测FABP7基因在各组织间mRNA的表达水平.结果 表明:草原红牛FABP7基因CDS区全长399 bp,编码132个氨基酸,蛋白分子量为14.96 ku,理论等电点为5.38,属于亲水性蛋白;通过NCBI-BLAST对比发现,草原红牛与普通牛、羊、猪、人、鼠、鸡的核苷酸序列同源性分别为99％、98％、94％、92％、85％、85％,系统进化树结果发现,草原红牛与普通牛亲缘关系最近,与鸡的亲缘关系最远;FABP7蛋白序列有1个二硫键,14个磷酸化位点,1个N-糖基化位点,不存在信号肽和跨膜区;在蛋白的二级结构和三级结构中发现,FABP7蛋白主要存在2个α-螺旋结构和10条β-折叠,为混合型蛋白.FABP7基因在小肠组织表达量最高,在心脏、脂肪和胃中中度表达.

关键词：草原红牛、FABP7基因、生物信息学、表达差异、脂质代谢

所属期刊栏目：55

分类号：S823.2(家畜)

资助基金：国家肉牛牦牛产业技术体系公主岭综合试验站CARS-37;国家重点研发计划项目2018YFD0501802;吉林省农业科技创新工程研究生基金;肉用草原红牛培育:畜禽品种培育项目

在线出版日期：2019-10-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：48-52,57