绵羊Lpin2基因CDS区克隆与生物信息学分析

摘要：

本研究应用RT-PCR、5'-RACE、TA克隆技术获得绵羊Lpin2基因CDS区,并进行相关生物信息学分析,为其遗传特性及编码蛋白功能机制的研究提供基础数据.结果获得绵羊Lpin2基因2 754 bp,包括84 bp的5'UTR和2 670 bp的CDS区,编码889个氨基酸.生物信息学分析编码蛋白lipin2属不稳定的中性亲水脂溶性蛋白,存在跨膜域、2个O-糖基化位点和89个磷酸化位点,没有信号肽,定位于细胞质或细胞器中.存在由细胞质活性氧(ROS)主导的氧化还原机制形成的二硫键.二级结构包含高比例的环(80.54％).蛋白N-末端和C-末端分别含有保守结构域Lipin_N和LSN2.绵羊与山羊、家牛、羊驼、猪、家犬、灵长类与啮齿类动物以及原鸡lipin2氨基酸序列同源,系统进化与其亲缘关系远近一致,Lpin2基因编码区进化保守.绵羊lipin2与lipin1氨基酸序列相似性相对较低(66％),可能与其有差异的功能活性有关.

关键词：绵羊、Lpin2基因、克隆、生物信息学

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分类号：S826.2(家畜)

资助基金：国家自然科学基金31372292

在线出版日期：2017-05-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：49-54,58