布莱凯特黑牛PDSS1基因的克隆测序及生物信息学分析

摘要：

对布莱凯特黑牛PDSS1基因cDNA进行克隆测序,为进一步研究PDSS1基因与布莱凯特黑牛胴体内CoQ10含量、肉质性状等的相关性提供理论基础.针对Ensembl公布的牛(参照)PDSS1基因中11个外显子,设计9对引物,对布莱凯特黑牛基因组DNA进行PCR扩增、克隆测序;利用软件Lasergene 7.0拼接出PDSS1基因cDNA,提交至GenBank并进行生物信息学分析.结果表明:布莱凯特黑牛PDSS1基因cDNA全长1 574 bp,包括一个长1 257 bp的完整开放阅读框,编码418个氨基酸.PDSS1蛋白含5个跨膜区,信号肽由26个氨基酸组成,成熟肽由392个氨基酸组成.布莱凯特黑牛与牛(参照)、海福特牛、马、猪、犬、小鼠、黑猩猩、人在编码区核酸序列同源性依次为99.9％、99.8％、89.0％、83.1％、88.6％、81.1％、80.8％、80.9％;推导氨基酸序列的同源性依次为100％、99.8％、92.0％、81.8％、91.6％、79.0％、80.4％、80.7％.本试验成功克隆了布莱凯特黑牛PDSS1基因cDNA,并提交至GenBank(登录号:KC787698).布莱凯特黑牛与牛(参照)、海福特牛在PDSS1基因编码区的同源性极高,聚为一类;与马、犬、猪、小鼠、人、黑猩猩等物种的同源性相对低些.

关键词：CoQ10、PDSS1、克隆测序、生物信息学、布莱凯特黑牛

所属期刊栏目：49

分类号：S823.2(家畜)

资助基金：国家科技支撑计划;山东省自主创新成果转化重大专项

在线出版日期：2014-06-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：14-18