鸡U6核内小RNA基因的克隆与分析

摘要：

本研究旨在获得鸡U6 snRNA的全序列,并对其序列、启动子及拷贝数等进行分析.本实验通过RT-PCR、克隆、测序获得了鸡U6snRNA的部分序列(94 bp).根据测序结果和鸡全基因组序列数据,结合生物信息学分析,结果获得了鸡U6 snRNA的全长序列(106 bp),该序列与人U6 snRNA序列相似性为100％,在鸡基因组中有4个拷贝,其中3个成簇存在于28号染色体上一段2 kb长的DNA片段上；另一个位于18号染色体.已有研究报道,这4个基因拷贝的5 ′侧翼区均具有启动子活性,说明它们是真基因.结果表明:这4个U6 snRNA基因启动子区均舍有潜在的远端序列元件(DSE)、近端序列元件(PSE)和TATA box等RNA聚合酶Ⅲ启动子元件.本研究成功获得了鸡U6 snRNA的全长序列,为选用U6基因作为内参基因开展鸡miRNA定量表达分析以及鸡U6基因的转录调控研究奠定基础.

关键词：核内小RNA、克隆、启动子、鸡

所属期刊栏目：49

分类号：S831.2(家禽)

资助基金：国家重点基础研究发展计划（973计划）;黑龙江省高等学校科技创新团队建设项目

在线出版日期：2013-07-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：17-21