鹅ATP5E基因cDNA克隆及生物信息学分析

摘要：

线粒体ATP酶合成体ε亚基(ATP synthase,H+transporting,mitochondrial F1 complex,epsilon,ATP5E)是ATP合成酶催化中心的最小亚基,在能量代谢过程中具有重要作用.本研究利用RT-PCR和RACE技术获得鹅ATP5E序列,并结合生物信息学方法对鹅ATP5E的序列进行深入分析.结果表明:克隆获得鹅ATP5E基因序列全长为347 bp,包括156 bp的编码区序列,编码51个氨基酸.同源性分析发现,鹅ATP5E核苷酸序列与推测氨基酸序列与原鸡的同源性最高,分别达到87.74％和89.58％,而与其他物种之间的一致性差异稍大.氨基酸序列分析发现该基因编码蛋白理论分子量为水溶性蛋白,相对分子量为5.79 ku,理论等电点为10.01,无信号肽序列和跨膜区,预测含有4个磷酸化位点,二级结构以α螺旋为主,预测ATP5E蛋白主要在能量代谢和脂肪酸代谢过程中有着关键作用.以上研究为进一步探讨ATPSE基因在鹅肝脂肪变性过程中的功能研究奠定了信息基础.

关键词：ATP5E、克隆、生物信息学分析、鹅

所属期刊栏目：49

分类号：S835.2(家禽)

资助基金：国家现代农业水禽产业技术体系CARS-43-6

在线出版日期：2013-07-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：5-9