泰国红色原鸡和中国红色原鸡mtDNA控制区遗传多态性和分类关系研究

摘要：

对泰国红色原鸡Gallus gallus gallus亚种和中国红色原鸡Callus gallus spadiceus亚种各16个个体mtDNAD-loop序列进行系统分析,测定线粒体D-loop部分序列大小约为560 bp,A、C、G、T这4种核苷酸的平均比例分别为13.6%、43.2%、4.3%和38.9%,A+T含量高于G+C含量.结果共发现27个变异位点,颠换和转换之比为0.13,没有观测到插入/缺失情况.测定的6种单倍型中,2个红色原鸡亚种没有共享单倍型,单倍型多样度分别为0.250和0.695,平均核苷酸差异数分别为3.750和10.833,核苷酸多样度分别为0.954%和2.757%.泰国红色原鸡中性检验的Tajima's D值为-1.800(p<0.05),不符合中性突变.2个红色原鸡亚种间核苷酸分歧度(Dxy)为2.847%,核苷酸净遗传距离(Da)为0.991%.序列群体间的方差组分(Va)占总变异的47.31%,Fst=0.473,差异极显著(p<0.01);群体间mtDNA D-loop Fst值也差异显著(p=0.035).红色原鸡2个亚种具有不同的群体遗传结构,群体之间存在明显的遗传分化,本研究支持这2个亚种并非是同一个亚种的观点.

关键词：mtDNA 控制区、遗传多态性、分类关系、红色原鸡

所属期刊栏目：44

分类号：S831.2(家禽)

资助基金：国家高技术研究发展计划（863计划）863-2006AA10ZIE7

在线出版日期：2009-03-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：5-8