哺乳中后期纯血马驹粪便细菌组成、丰度及多样性变化分析

摘要：

[目的]旨在探究哺乳中后期纯血马驹粪便细菌组成、丰度及多样性的变化,为优化马驹哺乳期护理及高效、健康养殖提供参考依据.[方法]选取出生日期相近、体重(144.33±16.10)kg的哺乳中后期纯血马公驹5匹,进行60 d的饲养试验.于马驹断奶前(3、4和5月龄)使用无DNA酶管采集粪便样品,利用Illumina MiSeq高通量测序平台检测粪便样品中微生物多样性.[结果]①3、4和5月龄马驹粪便菌群中共有OTU为627个,特有的OTU数量分别为202、177和194个;3个阶段马驹粪便Chao1、ACE、Shannon和Simpson指数均无显著差异(P＞0.05).主成分分析结果显示,马驹粪便中的菌群群落差异较小,较为稳定.②3、4和5月龄马驹粪便的优势菌门均为厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidota)、放线菌门(Actinobacteriota)、疣微菌 门(Verrucomicrobiota)和Patescibacteria等;优势菌科为毛螺旋菌科(Lachnospiraceae)、动球菌科(Planococcaceae)、微球菌科(Micrococcaceae)、颤螺旋菌科(Oscillospiraceae)和厌氧菌科(Anaerovoracaceae)等;优势菌属为节杆菌属(Arthrobacter)、嗜冷芽孢杆菌属(Psychrobacillus)、未分类的毛螺菌属(unclassified_Lachnospiraceae)、未培养的瘤胃细菌(uncultured_rumen_bacterium)和 Christensenellaceae_R_7_group 等.③门水平上,5 月龄马驹粪便疣微菌门相对丰度显著低于3月龄,螺旋体菌门相对丰度显著高于3、4月龄,纤维杆菌门相对丰度显著高于4月龄(P＜0.05);科水平上,3月龄马驹粪便阿克曼西亚科相对丰度显著高于4和5月龄(P＜0.05);属水平上,各月龄十大优势菌属间均无显著差异(P＞0.05).[结论]综上所述,在相同的饲养环境下,随着月龄的增加,马驹粪便菌群多样性指数呈波动性增长;粪便微生物排名前十的优势菌种类一致,但相对丰度存在差异,且马驹粪便中存在的差异菌随着月龄的增加而降低.

关键词：纯血马、马驹、粪便菌群、多样性分析

所属期刊栏目：50

分类号：S821.9(家畜)

资助基金：中国博士后科学基金2017M613307XB

在线出版日期：2023-11-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：3967-3975