秦川牛PLAG1基因启动子克隆及转录因子预测

摘要：

[目的]探究秦川牛多形性腺瘤基因1(pleomorphic adenoma gene 1,PLAG1)的组织表达规律,并克隆其启动子区序列,预测分析其关键转录因子结合位点,为探究其转录调控机制提供理论参考.[方法]采集3头20月龄秦川牛成年公牛心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、皮下脂肪、背最长肌、瘤胃组织,用实时荧光定量PCR方法检测PLAG1基因在不同组织中的相对表达量,同时克隆PLAG1基因上游启动子区序列,利用生物信息学软件预测PLAG1基因转录起始位点及启动子核心区域,分析、筛选核心启动子区域的关键转录因子结合位点.[结果]PLAG1基因在秦川牛各组织中均有表达,且在背最长肌中的表达量显著高于其他组织(P＜0.05).PLAG1基因启动子序列全长1 861 bp,生物信息学预测分析发现PLAG1基因核心启动子区位于-297-+42 bp,存在高度保守的Krüppel样因子5(KLF5)、cAMP反应元件结合蛋白1(CREB1)和早期生长反应因子1(EGR1)转录因子结合位点,且CpG岛位于PLAG1基因核心启动子区域内.[结论]PLAG1基因在肌肉组织中高表达,其核心启动子区位于-297-+42bp,KLF5、CREB1和EGR1转录因子对PLA G1基因的转录活性可能具有调控作用.本研究结果为进一步探究PLAG1基因的转录调控机制提供了理论依据.

关键词：秦川牛、PLAG1基因、启动子、转录因子

所属期刊栏目：50

分类号：S823(家畜)

资助基金：甘肃农业大学科技创新基金;甘肃农业大学学科团队项目;国家自然科学基金

在线出版日期：2023-08-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：2661-2669