苏姜猪不同生长阶段背膘组织差异表达基因及其调控通路分析

摘要：

[目的]比较苏姜猪背膘组织生长发育过程中基因表达谱的差异,挖掘影响背膘组织生长发育的关键基因.[方法]选择1、3、6和8月龄(M1、M3、M6、M8)4个生长时期苏姜猪背膘组织进行高通量转录组测序,组成3 个比对组(M1 vs M3、M3 vs M6、M6 vs M8)进行差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)的筛选,并进行功能富集和表达趋势分析.[结果]转录组测序显示,M1 vs M3、M3 vs M6、M6 vs M8组分别筛选到1 869、296、1 257个DEGs.功能富集显示,Wnt信号通路、细胞外基质-受体相互作用等信号通路在M1 vs M3组表现活跃,PI3K-Akt信号通路、AMPK信号通路、丁酸代谢、柠檬酸循环等信号通路在M6vs M8组表现活跃.基因表达趋势分析显示,富含半胱氨酸的酸性分泌蛋白(secreted protein,acid and rich in cysteine,SPARC)、组织蛋白酶S(recombinant cathepsin S,CTSS)、Kruppel 样因子 7(Kruppel-like factor 7,KLF7)等基因与细胞增殖发育相关,在3月龄时高表达;胰岛素样生长因子-1受体(insulin-like growth factor 1 receptor,IGF1R)、信号转导与转录激活因子 1(signal transducer and activator of transcription 1,STAT1)、脂肪酸合成酶(fatty acid synthase,FASN)等基因与细胞脂质代谢相关,在6月龄后表达显著上调.[结论]本研究获得苏姜猪4个生长时期背膘组织的基因表达谱,筛选到SPARC、CTSS、KLF7等与细胞增殖发育相关的关键基因,IGF1R、STA T1、FASN等与细胞脂质代谢相关的关键基因,为苏姜猪背膘厚的遗传改良提供了基础数据.

关键词：苏姜猪、转录组测序、背膘组织、差异表达基因

所属期刊栏目：50

分类号：Q786(基因工程（遗传工程）)

资助基金：江苏现代农业产业技术体系建设项目;泰州市科技项目;江苏农牧科技职业学院科技创新团队

在线出版日期：2023-08-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：2595-2605