鸭胸肌矿物元素含量全基因组关联分析

摘要：

[目的]试验旨在利用全基因组关联分析(GWAS)鉴定影响鸭胸肌矿物元素含量的候选基因及分子标记,解析矿物元素性状的遗传机制.[方法]研究构建了北京鸭×野鸭F2代资源群体,利用个体血液样本进行全基因组重测序,采集8周鸭胸肌并根据国标方法测定7种常量矿物元素含量,结合重测序数据与矿物元素表型数据进行全基因关联分析,鉴定影响矿物元素含量相关基因.[结果]7种矿物元素的表型遗传力分别为磷(0.007)＜铁(0.100)＜镁(0.120)＜钠(0.140)＜钾(0.150)＜钙(0.190)＜锌(0.350).相关性分析结果表明,镁和钾元素相关性最高(r=0.62),磷与镁、钾元素在鸭胸肌中的含量呈现较高的正相关,r值分别为0.43和0.56.通过GWAS鉴定出与锌元素含量显著相关的1个SNP位点在6号染色体12 075 283 bp处达到全基因组水平上的显著关联(-log10 P-value=8.03),与最高点SNP高度相关的39个SNPs将候选区间缩小至39 kb,该区间内仅存在1个基因SORCS3,结合基因功能注释与转录组分析确定SORCS3为锌元素含量变异的候选基因.与磷元素含量表型数据在全基因组水平上达到显著相关的最高点SNP与260个SNPs高度相关(R2＞0.4),均位于4号染色体17.1-18.6 Mb之间,且包含27个基因.结合相关性分析、基因功能注释及转录组分析,最终确定6个与磷元素含量高度相关的候选基因:TUSC3、MICU3、LOC101803915、MTMR7、SLC7A2和ASAH1.[结论]本研究利用全基因组关联分析鉴定出鸭胸肌锌元素含量候选基因SORCS3,同时结合转录组分析鉴定出与磷元素含量相关的6个候选基因.结果丰富了禽肉矿物营养的知识体系,为培育优良畜禽产品提供了重要的理论基础.

关键词：鸭、胸肌、矿物元素、全基因组关联分析、遗传力

所属期刊栏目：50

分类号：S834(家禽)

资助基金：中国农业科学院科技创新工程重大科研任务CAAS-ZDRW202104

在线出版日期：2023-05-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：1287-1295