10.16431/j.cnki.1671-7236.2023.03.020
多浪羊NPTX1基因克隆、生物信息学分析及在初情期的表达研究
[目的]试验旨在克隆多浪羊神经元正五聚体蛋白1(neuronal pentraxin 1,NPTX1)基因CDS序列,利用生物信息学分析NPTX1蛋白的结构和功能,并研究其在多浪羊初情期启动过程中性腺轴不同组织中的表达规律.[方法]采集初情期前、初情期、初情期后健康雌性多浪羊的下丘脑、垂体、输卵管、卵巢、子宫组织,提取总RNA并反转录成cDNA,以初情期前下丘脑cDNA为模板,PCR扩增多浪羊NPTX1基因并克隆测序,对其进行生物信息学分析;采用实时荧光定量PCR分析NPTX1基因在多浪羊下丘脑、垂体、卵巢、子宫、输卵管5个组织中的表达水平.[结果]克隆得到NPTX1基因长1 576 bp,其中CDS区序列为1 299 bp,与GenBank上预测的绵羊mRNA序列(登录号:XM_005683183.3)相似性达99.85%.系统进化树分析得出,多浪羊NPTX1基因与绵羊的遗传距离最近,与鸡的遗传距离最远.生物信息学分析发现,NPTX1蛋白为不稳定的亲水性酸性蛋白,具有1个信号肽,属于分泌蛋白;二级结构中α-螺旋和无规则卷曲占比分别为41.90%和40.73%,与三级结构预测结果一致.实时荧光定量PCR结果显示,NPTX1基因在多浪羊3个时期5个不同性腺组织中均有表达,在初情期下丘脑中表达量最高,显著高于初情期前和初情期后(P<0.05).[结论]试验成功克隆了多浪羊NPTX1基因CDS全长序列,并揭示了 NPTX1基因在多浪羊初情期不同阶段性腺轴组织中的表达差异性,为进一步探究NPTX1基因在多浪羊初情期启动过程中的调控机制提供依据.
多浪羊、NPTX1基因、克隆、初情期、组织表达
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S813.3(普通畜牧学)
国家自然科学基金;国家自然科学基金
2023-05-12(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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