绒山羊4个多胎性状候选基因多态性及其与产羔数的关联分析

摘要：

[目的]通过对内蒙古白绒山羊4个多胎性状相关基因进行测序和生物信息学分析,深入挖掘与产羔数显著相关的单核苷酸多态位点(single nucleotide polymorphisms,SNP)位点,为提升绒山羊高效繁育提供理论依据.[方法]选取阿拉善型、阿尔巴斯型绒山羊母羊244只,利用MultipSeq多重PCR结合二代高通量技术检测生长分化因子 9(growth differentiation factor 9,GDF9)、骨形态发生蛋白 15(bone morphogenetic protein 15,BMP15)、骨形态发生蛋白受体1B(bone morphogenetic protein receptor 1B,BMPR1B)和β-1,4-N-乙酰氨基半乳糖转移酶2(beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyl transferase 2,B4GALNT2)基因多态性,并对不同 SNP 位点与绒山羊产羔数进行关联分析.[结果]通过GATK分析共预测得到172个SNPs位点,其中BMPR1B、B4GALNT2、BMP15、GDF9基因相关SNPs位点分别为95、33、26和18个.GLM模型关联分析发现,10个SNPs位点与白绒山羊产羔数显著相关(P＜0.05),进一步进行卡方检验发现,其中7个SNPs位点基因型与产羔数显著相关(P＜0.05).BMPR1B基因 g.29893723 C＞G、g.29897064 G＞A、g.29897722 G＞A、g.29897734 C＞A 和 g.29938673 C＞G 位点的 CC、GG、GA、CA和CC基因型个体产羔数分别显著高于CG、GA、GG、CC和GG基因型(P＜0.05);B4GALNT2基因g.37072289 G＞A位点的GG和GA基因型个体产羔数均显著高于AA基因型(P＜0.05);GDF9基因g.66027842 A＞C位点的CC和AC基因型个体产羔数均显著高于AA基因型(P＜0.05).[结论]试验获得了内蒙古白绒山羊多胎性状相关基因GDF9、BMP15、BMPR1B和B4GALNT2的SNPs位点序列特征,发现了与白绒山羊产羔数显著相关的10个SNPs位点,并揭示了不同基因型产羔数间的差异,从而为内蒙古白绒山羊分子辅助育种提供了有力的SNP参考位点.

关键词：绒山羊、GDF9基因、BMP15基因、BMPR1B基因、B4GALNT2基因、产羔数

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分类号：S813.3(普通畜牧学)

资助基金：内蒙古创新基金项目;内蒙古自治区科技计划项目;内蒙古自治区科技成果转化引导项目;鄂尔多斯市绒山羊重大专项;内蒙古自治区绒山羊重大专项

在线出版日期：2023-05-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：1037-1047