miR-192进化分析、靶基因预测及组织表达分析

摘要：

[目的]研究miR-192的生物进化进程和潜在靶基因功能,以及miR-192在大围子猪(脂肪型猪)和大约克夏猪(瘦肉型猪)脂肪组织中的差异表达.[方法]利用miBase数据库获取miR-192成熟序列,并利用Ensembl数据库定位miR-192在不同物种基因组的分布特征;采用Mega 11.0软件程序构建miR-192系统进化树;通过实时荧光定量PCR检测miR-192在大围子猪和大约克夏猪背部脂肪组织中的表达情况,并比较表达差异;利用不同在线网站预测猪miR-192靶基因,并对靶基因进行GO功能和KEGG通路富集分析.[结果]miR-192在生物进化过程中具有高度保守性;实时荧光定量PCR结果显示,miR-192在大围子猪背部脂肪组织的表达量极显著高于大约克夏猪(P＜0.01));GO功能和KEGG通路富集分析结果表明,miR-192靶基因主要起转录前调节和结合的作用,且主要在染色质和细胞核中发挥作用,多数基因富集在与脂肪代谢相关的信号通路;对3个网站不同物种预测结果取交集共获得猪miR-192保守靶基因5个.[结论]miR-192在生物进化过程中具有高度保守性,可能通过靶向调节靶基因的表达,从而在猪脂肪组织分化中起作用,为进一步探讨miR-192在脂肪组织分化中的调控机制提供理论其础.

关键词：猪、miR-192、进化分析、脂肪组织、靶基因

所属期刊栏目：50

分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

资助基金：湖南省自然科学基金项目;湖南省创新平台与人才计划种业创新项目;湖南省重点研发计划项目;湖南省重点研发计划项目;湖南省重点实验室开放研究基金项目;湖南生猪产业技术体系建设项目

在线出版日期：2023-05-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：882-892