梅花鹿MSRB3基因多态性及其与茸重性状的关联分析

摘要：

[目的]本研究旨在探索梅花鹿甲硫氨酸亚砜还原酶B3(methionine sulfoxide reductase B3,MSRB3)基因多态性及其与茸重性状的关联性.[方法]选取高、低产茸量的梅花鹿各8只,应用DNA直接测序法检测基因变异位点.采用MassARRAY? SNP分型技术对314头24月龄梅花鹿MSRB3基因进行基因分型,并结合梅花鹿茸重性状数据进行了关联分析和单倍型分析.[结果]在梅花鹿MSRB3基因中共发现6个SNPs位点,其中2个SNPs位点位于外显子区域,且突变均未引起氨基酸改变,属于同义突变,其余4个SNPs位点均存在于内含子区域.分型结果显示4个样本未分型成功,其余310个样本进行后续分析.各位点观测杂合度和期望杂合度基本一致,g.44455582 T＞C、g.44455759 C＞T、g.44414424 T＞C、g.44350306 T＞C 及 g.44340836 G＞A 等 5 个位点的杂合度较高,均属于中度多态(0.25＜PIC＜0.5),g.44340734 G＞C位点杂合度较低,属于低度多态(PIC＜0.25).卡方检验结果表明,g.44455759 C＞T位点偏离Hardy-Weinberg平衡状态(P＜0.05),其他5个位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P＞0.05).对6个SNPs位点的不同基因型与梅花鹿茸重的关联分析结果表明,g.44455582 T＞C位点的TT基因型个体茸重极显著高于CC和TC基因型(P＜0.01).单倍型分析结果显示,g.44340734 G＞C 和g.44350306 T＞C、g.44455582 T＞C 和 g.44455759 C＞T 位点存在强连锁,各产生 3 种单倍型,在Block 2区块中单倍型TC茸重显著高于单倍型CT(P＜0.05).[结论]MSRB3基因与梅花鹿茸重性状密切相关,g.44455582 T＞C位点和单倍型TC可作为筛选高产梅花鹿的分子标记.

关键词：梅花鹿、MSRB3基因、SNPs、茸重

所属期刊栏目：49

分类号：S825(家畜)

资助基金：吉林省科技发展规划重点转化项目;吉林省发展和改革委员会创新能力建设

在线出版日期：2023-01-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：4279-4287