中国草原红牛 PDK4基因多态性及其与肉质性状的关联分析

摘要：

[目的]研究中国草原红牛丙酮酸脱氢酶激酶4(pyruvate dehydrogenase kinase 4,PDK4)基因多态性与肉质性状的关系.[方法]挑选120头中国草原红牛为研究对象,采用Sanger测序法检测PDK4基因第1～11外显子的单核苷酸多态性(SNP)位点,分析SNP位点的基因型频率、基因频率及群体遗传参数等.利用SPSS 21.0软件对中国草原红牛PDK4基因SNP位点多态性与肉质性状(熟肉率、肉嫩度、失水率、pH、滴水损失、肌内脂肪含量、初水分含量、蛋白质含量)进行关联分析.[结果]在中国草原红牛PDK4基因外显子8和外显子11上共检测到3个SNPs;PDK4基因第8外显子57 bp处存在1个SNP位点(G57C),且引起编码氨基酸的改变,存在GG、GC和CC 3种基因型;PDK4基因第11外显子在330和389 bp处存在2个SNPs位点(G330T和C389T),在G330T位点上存在GG、GT和TT 3种基因型;在C389T位点上存在CC、CT和TT 3种基因型.卡方适合性检验结果显示,中国草原红牛第8外显子G57C位点偏离Hardy-Weinberg平衡状态(P＜0.05),第11外显子的G330T和C398T符合Hardy-Weinberg平衡状态(P＞0.05);群体遗传参数分析发现,第8外显子G57C突变位点属于低度多态性位点(PIC＜0.25),等位基因数为1.1429,表明其在中国草原红牛中的变异较小;第11外显子G330T和C398T属于中度多态性位点(0.25＜PIC＜0.5),等位基因数分别为1.6431和1.6447,说明该遗传标记能够提供遗传信息.关联分析结果表明,PDK4基因第8外显子中G57C位点GG和CC基因型个体肌内脂肪含量显著高于GC基因型(P＜0.05);第11外显子G330T位点GG基因型滴水损失和初水分量显著高于GT基因型(P＜0.05);GG基因型肉嫩度显著高于TT基因型(P＜0.05);GT基因型肌内脂肪含量显著高于TT基因型(P＜0.05),C389T处CT基因型失水率显著低于TT基因型(P＜0.05).[结论]PDK4基因多态性与中国草原红牛肉质性状相关,可作为肉质性状的候选基因.

关键词：PDK4基因、中国草原红牛、肉质性状、多态性、关联分析

所属期刊栏目：49

分类号：S813.3(普通畜牧学)

资助基金：国家肉牛牦牛产业技术体系项目;吉林省科学技术厅重点科技研发项目;吉林省畜禽良种工程项目;吉林省农业科学院国际合作项目;吉林省农业科技创新工程高品质肉牛培育

在线出版日期：2022-06-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：2186-2194