F3代波杂山羊VNN1基因多态性及其与产羔数的关联分析

摘要：

[目的]研究泛酰巯基乙胺酶-1(panthenoyl mercaptoethamine-1,VNN1)基因多态性与F3代波杂山羊产羔数的关系,从而从分子水平指导F3代波杂山羊的育种工作.[方法]选取107只F3代波杂山羊,采集血样提取DNA,根据VNN1基因(登录号:NC_030816.1)外显子序列设计7对引物,进行PCR扩增及测序,运用DNAStar软件分析测序结果,对可能存在的单核苷酸多态性(SNP)位点外显子全群进行PCR扩增测序,并进行Hardy-Weinberg平衡状态及遗传多样性分析;应用SPSS 16.0统计学软件对VNN1基因不同基因型与F3代波杂山羊产羔数进行关联分析.[结果]在VNN1基因在第5和7外显子中共发现7个SNPs位点:g.10956 A→G、g.11010 C→T、g.11103 C→T、g.11284 C→A、g.11313 T→C、g.18094 C→T 和 g.18158 G→C,且每个位点均存在3种不同基因型.x2检验显示,g.10956 A→G、g.11010 C→T、g.11103 C→T、g.11313 T→C 和 g.18094 C→T 位点均处于 Hardy-Weinberg平衡状态,g.11284 C→A和g.18158 G→C位点均处于Hardy-Weinberg不平衡状态.多态信息含量均为中度多态((0.25＜PIC＜0.5).关联分析发现,g.11010 C→T和g.11313 T→C位点与F3代波杂山羊产羔数显著相关,其中g.11010 C→T位点CC基因型产羔数显著低于CT和TT基因型,g.11313 T→C位点TT基因型产羔数显著低于TC和CC基因型(P＜0.05);g.10956 A→G、g.11103 C→T和g.18158 G→C位点对F3代波杂山羊产羔数均无显著影响(P＞0.05).[结论]VNN1基因在第5和7外显子中共发现7个SNPs位点,其中g.11010 C→T和g.11313 T→C位点对F3代波杂山羊产羔数有显著影响,VNN1基因可作为F3代波杂山羊的候选基因.

关键词：VNN1基因、F3代波杂山羊、单核苷酸多态性(SNP)、产羔数、关联分析

所属期刊栏目：49

分类号：S813.3(普通畜牧学)

资助基金：贵州省科技支撑计划项目;贵州省科技重大专项;贵州大学培育项目

在线出版日期：2022-06-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：1384-1392