关岭牛TBC1D7基因多态性及其与生长性状的关联分析

摘要：

为探究TBC1蛋白家族第7成员(TBC1 domain family member 7,TBC1D7)基因单核苷酸多态性(SNP)对关岭牛生长性状的影响,试验选取116头贵州关岭牛,测定其8项生长性状指标,提取血液基因组DNA,并利用DNA混池扩增TBC1D7基因全部外显子,通过直接测序法筛查SNP.利用不同独立样本DNA扩增SNP位点对应外显子并测序,以验证位点并进行基因分型.利用SPSS 19.0软件单因素方差分析TBC1D7基因不同基因型和关岭牛生长性状之间的相关性.结果 显示,在TBC1D7基因第5、6和8外显子上共发现5个SNPs位点:g.12972 T＞C、g.12984 A＞G、g.20538 C＞T、g.20577 T＞C和g.24807 G＞A,均存在3种基因型;x2检验结果显示,5个SNPs位点均显著偏离Hardy-Weinberg平衡状态(P＜0.05);群体遗传参数分析发现,5个SNPs位点杂合度较高,多态信息含量均表现为中度多态(0.25＜ PIC＜0.5).关联性分析结果发现,关岭牛TBC1D7基因g.24807 G＞A位点GA基因型个体体斜长、胸围和后臀围均显著高于AA基因型个体(P＜0.05).在本试验群体中,5个SNPs存在6种单倍型(H1～H6)和9种双倍型(H1H1、H2H2、H2H3、H2H6、H3H3、H3H4、H3H5、H3H6和H5H5),其中H3和H2为优势单倍型,H3H3、H2H2和H2H3为优势双倍型;双倍型关联分析结果显示,H3H6和H5H5个体体斜长和后臀围相比其他双倍型个体占有明显优势,可能是有利基因型.结果 表明,TBC1D7基因g.24807 G＞A位点为影响关岭牛生长发育的重要多态位点,本研究为筛选有助于关岭牛生长发育的分子标记提供了理论参考.

关键词：关岭牛;TBC1D7基因;SNPs;生长性状;相关性

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分类号：S813.3(普通畜牧学)

资助基金：贵州省农业动植物育种项目;贵州省农业科技攻关项目;贵州省科技支撑计划

在线出版日期：2021-09-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：2853-2863