牦牛EPO、PPARα基因SNP与高原低氧适应的相关性分析

摘要：

试验旨在探究促红细胞生成素基因(EPO)、过氧化物酶体增殖剂激活受体α(PPARα)的遗传多样性,并分析其多态性与牦牛高原低氧适应性的相关性.采集不同海拔高度的6个牦牛类群(中甸牦牛、麦洼牦牛、斯布牦牛、类乌齐牦牛、帕里牦牛、申扎牦牛)以及三江黄牛共375头耳样,提取DNA并分别构建DNA池,采用直接测序法结合PCR-RFLP检测分析EPO、PPARα基因的多态性,最后应用SHEsis软件统计分析候选基因SNPs与牦牛高原适应性的相关性.结果表明,EPO基因存在3个SNPs位点:rs527G→A、rs1031A→T、rs1192T→C;PPARα基因存在3个SNPs位点:rs77363C→T、rs77471C→A和rs77534C→T.x2适合性检验结果显示,EPO基因3个SNPs位点均符合Hardy-Weinberg平衡状态;PPARα基因的rs77363C→T位点上,6个牦牛类群都处于平衡状态(P＞0.05),在 PPARα基因的 rs77471C→A 和 rs77534C→T 位点,麦洼牦牛偏离 Hardy-Weinberg 平衡(P＜0.05).单倍型分析得出,EPO基因的ATC单倍型在高海拔地区牦牛中的分布频率随海拔升高而升高;PPARα基因的TAC单倍型在6个牦牛类群中分布频率显著高于其他单倍型.研究表明,EPO、PPARα基因可作为牦牛适应高原环境的分子标记,为进一步探讨牦牛高原低氧适应性机制提供一定理论帮助.

关键词：牦牛、EPO 基因、PPARα基因、SNP、高原低氧适应性

所属期刊栏目：48

分类号：S823.85(家畜)

资助基金：国家肉牛牦牛产业技术体系项目;四川省科技计划;中央高校基本科研业务费专项

在线出版日期：2021-07-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共14页

页码：1633-1646