广灵驴DGAT2基因克隆、生物信息学分析及组织表达研究

摘要：

本研究旨在对广灵驴二酰基甘油酰基转移酶2(DGAT2)基因进行克隆,生物信息学分析和检测其在不同组织中的表达情况,为探究DGAT2基因在广灵驴脂肪沉积和提高乳脂率等方面的作用机制提供理论参考.根据GenBank上公布的马(登录号:XM_023645689.1)、双峰驼(登录号:XM_010973154.1)、绵羊(登录号:XM_027979550.1)等物种的DGAT2基因mRNA序列,利用Primer Premier 3.0在线工具设计同源引物,应用RT-PCR法扩增DGAT2基因序列,用生物信息学方法分析DGAT2基因编码序列,用实时荧光定量PCR技术检测DGAT2基因在广灵驴心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、背最长肌、肌间脂肪、皮下脂肪组织中的表达.结果显示,广灵驴DGAT2基因CDS序列1 086 bp,编码361个氨基酸,提交到GenBank,获得登录号:MT993643,其编码序列与马、牛、双峰驼、猪、绵羊、人、小鼠的同源性分别为99.0％、92.0％、93.5％、92.0％、92.7％、85.3％、84.1％.系统进化树分析表明,驴与马的亲缘关系最近,和小鼠的关系最远.DGAT2蛋白分子质量40.96 ku,脂肪系数92.85,等电点9.16,是一种具有跨膜区的稳定碱性疏水蛋白.DGAT2蛋白有28个磷酸化修饰位点,2个糖基化修饰位点,没有信号肽,主要定位在内质网,α-螺旋(39.89％)和无规则卷曲(36.01％)是主要的二级结构.DGAT2基因在检测的8个组织中都有表达,其中皮下脂肪中的表达量显著高于其余组织(P＜0.05),其次是心脏、肝脏和肾脏,背最长肌中的表达量最低.本试验结果为探究DGAT2基因在广灵驴脂肪沉积和提高乳品质性状的作用奠定基础.

关键词：DGAT2基因、广灵驴、基因克隆、生物信息学分析、组织表达

所属期刊栏目：48

分类号：S822(家畜)

资助基金：山西省重点研发计划指南项目:国际科技合作方面;山西农业大学横向科技项目

在线出版日期：2021-03-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：407-416