猫importin基因生物信息分析及其在犬细小病毒感染F81细胞表达的动态变化

摘要：

试验旨在系统研究猫源不同亚型importin(importin α1、importin α3、importin α4、importin α5、importinα6、importin α7、importin α8和importin β)基因序列和蛋白基本特性,探讨其在犬细小病毒(canine parvovirus,CPV)感染F81细胞表达的动态变化.本研究利用RT-PCR方法扩增F81细胞中improtin基因全长序列,应用生物学软件预测其氨基酸序列及编码蛋白的结构及功能;进一步利用实时荧光定量RT-PCR技术检测importin基因在CPV感染F81细胞后24、48和72 h表达水平.结果显示,不同亚型importin α基因全长约在1 500 bp,而importin β基因全长为2 600 bp;预测importin亚型蛋白序列发现,其等电点均在4.60左右,且发现importin α1、importin α5、importin α6、importin α7和importinβ为不稳定蛋白;分析发现这些importin蛋白均无信号肽、无跨膜区、无细胞定位;采用Predictprotein软件预测蛋白二级结构,结果显示importin亚型蛋白序列主要以α-螺旋和无规则卷曲形式存在.实时荧光定量RT-PCR结果显示,CPV感染F81细胞后随着感染时间的延长importin α1(P＜0.01)和importinβ表达量逐渐降低,而importin α3、importin α4、importin α5、importin α6(P＜0.01)、importin o7(P＜0.01)和importin α8(P＜0.01)表达量逐渐提高,其中importin α8在病毒感染细胞后表达量最高.本研究结果为进一步分析CPV进入细胞核的转运机制及开发治疗药物相关研究奠定基础.

关键词：输入蛋白、犬细小病毒(CPV)、序列分析、表达差异

所属期刊栏目：47

资助基金：国家自然科学基金3170131433

在线出版日期：2021-02-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：3861-3869