川中黑山羊和雷州山羊大小卵泡转录组学分析

摘要：

试验旨在通过比较两个品种山羊大小卵泡的mRNA表达图谱来挖掘影响山羊卵泡发育的基因,为进一步阐述山羊卵泡发育机制提供数据基础.使用氯前列醇钠对川中黑山羊和雷州山羊进行同期发情处理,屠宰后采集卵巢并在体视显微镜下分离单个卵泡(大卵泡＞6 mm;小卵泡＜3 mm),提取卵泡组织总RNA进行RNA-seq,利用生物信息学方法检测mRNA表达谱,筛选差异基因,并对其进行GO功能、KEGG通路富集分析.结果 显示,川中黑山羊大小卵泡差异基因共4 451个,雷州山羊2 355个,二者共有差异基因1 771个.分析筛选出两个品种共有(INHBA、INHA、CYP19A1、KITLG、LHCGR和STAR)及各自特有(IGFBP6、BMP6和BMPR2)的已报道与卵泡发育相关的基因,此外还筛选出可能与这两种山羊繁殖性能相关的基因(GADD45B、TC2N和MSMO1).GO功能分析显示,两个品种共有差异基因主要与各种物质的跨膜转运活性有关;KEGG通路分析显示,类固醇生成、细胞因子受体相互作用和cAMP信号通路在两个品种中均存在显著变化.类固醇生成过程中细胞色素P450代谢差异可能是川中黑山羊高产仔数的一个潜在因素.本研究结果为进一步探究山羊卵泡发育的基因功能及不同山羊品种繁殖性能差异提供参考.

关键词：山羊、卵泡、转录组、基因

所属期刊栏目：47

分类号：S814.8(普通畜牧学)

资助基金：广东省畜禽地方品种保护与开发利用提升工程;广东省现代农业产业技术体系;广东省教育厅青年创新人才项目

在线出版日期：2020-06-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共13页

页码：1459-1471