猪ASB2基因CDS区克隆、生物信息学分析及表达规律研究

摘要：

本研究旨在克隆猪锚蛋白重复序列和细胞信号抑制因子盒蛋白2(ankyrin repeat and suppressor of cytokine signalling box containing protein 2,ASB2)基因完整CDS区序列,通过生物信息学方法分析CDS序列和蛋白质基本特性,探讨其在晋汾白猪不同组织及卫星细胞诱导成肌过程中的表达规律.选取1日龄晋汾白猪为研究对象,依据GenBank中猪ASB2基因预测核苷酸序列设计引物,以背最长肌组织cDNA为模板,采用分段扩增法进行猪ASB2基因的克隆.利用生物信息学软件分析ASB2氨基酸序列及编码蛋白质的结构和功能,利用实时荧光定量PCR技术检测ASB2基因在猪不同组织及卫星细胞诱导成肌过程中的表达水平.结果 显示,猪ASB2基因完整CDS区序列长1 824 bp,共编码607个氨基酸.猪ASB2基因核苷酸序列与山羊和牛的相似性最高.生物信息学分析发现,ASB2蛋白为亲水性蛋白,共有54个磷酸化位点,11个O-糖基化位点,1个N-糖基化位点,没有信号肽.保守结构域分析结果表明存在11个ANK基序和1个SOCS基序.猪ASB2蛋白二级结构中无规则卷曲、α-螺旋、β-转角和延伸链分别占43.99％、40.36％、10.05％和5.60％.实时荧光定量PCR结果显示,ASB2基因在猪腰大肌组织中表达量最高,其次为背最长肌和心脏,且与其他组织中表达量具有极显著差异(P＜0.01);在诱导卫星细胞成肌过程中发现该基因表达量呈先升高后降低趋势,提示其可能参与调控肌肉生长过程.本研究结果可为进一步探讨猪ASB2基因功能及作用机制提供参考依据.

关键词：猪、ASB2基因、克隆、序列分析、表达

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分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

资助基金：国家自然科学基金;三晋学者支持计划专项经费;山西省“1331工程”2017;山西省农业重点研发项目;山西农业大学畜牧学学科建设专项课题2017

在线出版日期：2020-06-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：1289-1298